(4)10% 過硫酸銨,5ml(0.5g過硫酸銨, 加5ml蒸餾水, 新鮮配置),-20℃保存一個月左右。
(5)10% (w/v)SDS,10g SDS加蒸餾水100ml, 室溫保存。
(6)10% TEMED 0.1ml TEMED , 加0.9 ml蒸餾水。
(7) 2×上樣緩沖液(10ml):0.6ml 1mol/L Tris-HCL (pH6.8),4ml 50%的甘油,2ml 10% SDS,
2ml 1mol/L 二硫蘇糖醇(DTT),1ml 1%溴酚藍,0.9ml蒸餾水,可在4℃存放數周,或在-20℃保存數月。
(8) 5×電泳緩沖液 (1L):15.1g Tris堿,72g甘氨酸,50ml 10%SDS 加蒸餾水至1L,pH 8.3。
(9)考馬斯亮藍染色液:1.0g考馬斯亮藍R-250,450ml甲醇,100ml冰醋酸,450ml蒸餾水定容至 1000ml。
(10)考馬斯亮藍脫色液:100ml甲醇,100ml冰醋酸,800ml蒸餾水。
【實驗方法與步驟】
1. 分離膠的制備
(1)凝膠中丙烯酰胺的百分比濃度(X%)與蛋白質的分辨范圍
(2)分離膠的配方:
30%丙烯酰胺儲存液、4 ×分離膠緩沖液、蒸餾水、10%過硫酸銨、TEMED
灌制分離膠。
(3)分離膠的灌制:
(1)按說明書組裝好凝膠模具,對于Bio-Rad 微型凝膠系統,在上緊夾具之前,必須確保兩塊凝膠玻璃板和底部的封膠橡膠條緊密接觸,避免漏膠。
(2)將30%丙烯酰胺儲存液與4x分離膠緩沖液以及蒸餾水在一個小燒杯中混合。
(3)加入過硫酸銨和TEMED后,輕輕攪拌混勻(凝膠會很快聚合,操作要迅速)。
(4)將凝膠溶液用吸管沿長玻板壁緩慢加入制膠模具中,避免產生氣泡。凝膠液加至約距前玻璃板頂端1.5cm(距梳子齒約 0.5cm),接著在分離膠溶液上輕輕覆蓋約1cm高的蒸餾水以封膠。約30min后,若在分離膠與水層之間可見一個清晰的界面,表明凝膠已聚合。
3. 濃縮膠的配方 5%的濃縮膠4ml, 用于Mini-Protein Ⅲ 型電泳槽
4. 濃縮膠的灌制
(1)向一側傾斜制膠模具,吸掉覆蓋在分離膠上的水;將30%丙烯酰胺儲存液與4x濃縮膠緩沖液及蒸餾水在小燒杯內混合,加入過硫酸銨和TEMED,輕輕攪拌使其混勻。
(2)將濃縮膠溶液用吸管加至分離膠上面,直至前玻璃板的上緣。
(3)迅速將點樣梳插入凝膠內,直至梳齒的底部與前玻璃板的上緣平齊。待凝膠聚合 (約30min) 后,小心拔出點樣梳。
5. 預電泳 將1X電泳緩沖液加入內外電泳槽,使凝膠的上下端均能浸泡在電泳緩沖液內;接通電源,上槽為負極,下槽為正極,80V預電泳3~5min。
6. 樣品制備/上樣/電泳 將20?滋l蛋白質樣品與20?滋l 2×上樣緩沖液,在Eppendorf管中混合,100℃加熱3~5min;離心
5~10s,用微量注射器或移液器將樣品(棄沉淀)緩慢滴入凝膠梳孔中;繼續低電壓(80V)電泳至樣品進入分離膠,再將電壓調至150V,保持恒壓電泳,直至染料遷移至凝膠的底部(對于兩塊6cm×8cm×0.75mm的凝膠,約需50min),電泳結束。
小心撬開玻璃板,凝膠便貼在其中一塊板上;切去濃縮膠和某一膠角(作標記)。
7. 染色與脫色 將凝膠浸入考馬斯亮藍染色液中,置搖床上緩慢震蕩30min以上(染色時間需根據凝膠厚度適當調整)。取出凝膠在水中漂洗數次,再加入考馬斯亮藍脫色液、震蕩。凝膠脫色至大致看清條帶約需1h,完全脫色則需更換脫色液2~3次,震蕩達24h以上。
凝膠脫色后可通過掃描、攝錄等方法進行蛋白質定量檢測。
【注意事項】
1. 凝膠不聚合的可能原因
(1)試劑質量差,應使用電泳級別的試劑。
(2)過硫酸銨和TEMED的量不夠或失活,可增加劑量或重配新鮮的儲存液。
(3)凝膠聚合時溫度太低,應以室溫為宜。
2. 上樣時,樣品不能沉到加樣孔底部,可能是上樣緩沖液中甘油含量不足;或是加樣孔底部留有聚合的丙烯酰胺。
3. 經過煮沸的樣品雖然可以在-20℃保存數周,但若反復凍融會導致蛋白質的降解。從-20℃取出的樣本,上樣前應先升至室溫,確保SDS沉淀溶解。
4. 注意避免電泳條帶彎曲畸變:①“微笑”
現象(如圖25-1所示),可能是因為凝膠中間部分溫度過高,降低電壓便可得到改善.②“皺眉”現象,常常是因為凝膠底部有氣泡或聚合不均勻。③“拖尾”、“紋理”現象,則多為樣品溶解不佳,增加蛋白樣品的溶解度并離心除去不溶性顆粒即可克服。④“暈輪”效應(holo
effect)多為加樣過量所致。
5. 非特異性的染色主要是由于未溶解的染料的沉積而成,應將染料溶液過濾后再用。
6. 如果電泳后將對蛋白質進行定量檢測,須特別注意:1)已知和未知樣品必須使用相同的溶劑系統、相同的濃度、相同的加樣量,并在同一塊凝膠上電泳和染色。