Invitrogen提供了大量的涵蓋面廣的蛋白分離預制膠，包括不同的成分，百分比濃度和格式。使用合適的膠百分比濃度，緩沖系統，上樣孔格式以及膠的厚度，對于獲得最好的結果非常重要。以下提供了幫助你選擇適合你應用的正確凝膠的信息。
E-PAGE? 96 High-Throughput System是整合的、無緩沖液系統，設計用來檢測和分析大量的蛋白樣品，時間僅僅需要14分鐘。
NuPAGE? Novex Gels組合了完美的技術和極度的可靠性。貨架期長達12個月，比其它蛋白凝膠需要的電泳時間更短，中性pH值，為大多數蛋白的分離和轉移提供優良的性能。現在可以獲得8個分離范圍，分離絕大多數不同大小的蛋白。
Novex? Tris-Glycine Gels基于傳統的Laemmli buffer system，可能被使用在所有鞍椎姆擲搿Ｍü齀nvitrogen公司可以獲得12種不同百分比濃度和加樣孔大小的凝膠。
Novex? Tricine Gels是分離肽和低分子量蛋白的理想凝膠。
Novex? Zymogram Gels使用gelatin或者casein作為底物分離活性蛋白酶，可以鑒定蛋白酶的大小和活性。
預制聚丙烯酰胺凝膠一般信息：
基質： 聚丙烯酰胺
厚度： 1.0mm或者1.5mm
大小： 8cm（h）x8cm（w）
cassette 大小： 10cm（h）x 10cm（w）
加樣孔格式：17孔，15孔，12孔，10孔，9孔，5孔，1孔，2D/準備 孔或者IPG孔
堆積膠：大多數Novex? gels為4%堆積膠
* Novex?預制膠適用于XCell SureLock? Mini-cell和大部分其它設計為10cm（h）×10cm（w）gel
cassette的mini-cells。E-PAGETM預制膠適用于E-Gel? Base，E-Gel?
PowerBaseTMv.4或者E－Base?單元。
選擇合適的凝膠百分比濃度
一般而言，分離分子的大小應該決定你選擇丙烯酰胺的濃度。使用低百分比濃度凝膠分離較大的分子，高百分比濃度的凝膠分離較小的分子。進行等電聚焦時，這條規則例外。參看凝膠遷移圖發現最適合你應用的凝膠。通常，為了達到最佳的分辨率，分子應該移動通過凝膠長度的70％。當蛋白分子量范圍寬或者未知，梯度膠通常是最好的選擇。
選擇加樣孔格式和凝膠厚度
我們提供大部分聚丙烯酰胺凝膠為9孔的格式（17孔，15孔，12孔，10孔，9孔，5孔，1孔，2D/準備
孔或者IPG孔）。一些類型的凝膠可以得到兩種厚度（1.0mm和1.5mm）。如果上樣量大（＞30μl）時，使用較厚的凝膠（1.5mm）和較少的上樣孔（5孔）更為合適。如果blotting，記住蛋白從1.0mm的凝膠中比從1.5mm的厚膠中更容易轉移。表1總結了各種類型凝膠的特定和應用。使用表2確定哪一種上樣孔格式最適合容納你的樣品量。
表1 選擇使用膠的類型
| 膠的類型 | 膠濃度 | 分離范圍 | 貨架期 | 平均電泳時間 | 應 用 | |
| 蛋白質分析 | E-PAGE? 96 | 6% | 10-200 kDa | 1年 | 14分鐘 | 高通量、變性蛋白的分離，以進行重組生產分析和蛋白譜研究，可以電泳后染色和western blots |
| NuPAGE? Bis-tris | 10%,12%,4-12% | 1.5-300 kDa | 1年 | 35-50分鐘 | pH中性,12個月貨架期凝膠。對于變性和還原蛋白具有優良的分辨率。是分析小到中等大小蛋白的最佳選擇。 | |
| NuPAGE? Bis-Acetate | 7%,3-8% | 30-400 kDa | 8個月 | 60分鐘 | 8個月貨架期的高性能凝膠。對于較大的蛋白效果極佳。也能夠用來做非變性電泳（native）。 | |
| Tris-Glycine | 4%,6%,8%,10%,12%,4-20%,4-12%,14%,16%,18%,8-16%,10-20% | 6-500 kDa | 1-2月 | 90分鐘 | 準確和可重復的分離非變性（native）和變性蛋白。可以得到各種范圍的Laemmli-style 凝膠。 | |
| Tricine | 10%,16%,10-20% | 2-200 kDa | 1-2月 | 90分鐘 | 小肽的分離 | |
| IEF | pH3-7，pH3-10 | pI3.0-pI8.5 | 5月 | 150分鐘 | 根據等電點分離可溶性蛋白。 | |
| Zymogram | 10%(gelatin),12%(casein),4-16%(casein) | 30-200 kDa | 2個月 | 90分鐘 | 利用casein 和gelatin作為底物，確定特別活性蛋白酶。 |
| 聚丙烯酰胺凝膠 | 1孔 | IPG孔 | 2D孔 | 5孔 | 9孔 | 10孔 | 12孔 | 15孔 | 17孔 | |
| 最大上樣量/孔 | 1.0 mm厚度 | 700 μl | 7 cm IPG條 | 400 μl | 60 μl | 28 μl | 25 μl | 20 μl | 15 μl | 15 μl |
| 1.5 mm厚度 | n/a | n/a | 600 μl | n/a | n/a | 37 μl | n/a | 25 μl | n/a | |
| 推薦獲得最佳分辨率的最大上樣量* | 每條蛋白帶，考馬斯亮蘭染色 | 12 μg | n/a | 12 μg | 2 μg | 0.5 μg | 0.5 μg | 0.5 μg | 0.5 μg | 0.5 μg |
|
注釋：E-Gel? 要求20μl樣品量/孔 。 *NuPAGE? 膠比Tris-Glycine 或Tricine有更高的蛋白上樣能力。 |