環狀RNA (circRNA)作為新型非編碼RNA,具有比線性RNA更加穩定的環狀結構,可通過多種機制調控靶基因。近年來,circRNA被發現在多種腫瘤組織和細胞中異常表達,作為腫瘤的診斷生物標志物或治療靶點,具有巨大的價值,受到廣泛的關注。癌癥新的證據表明,circRNAs在癌癥的發生發展中起著重要的調控作用。云序用戶山東大學劉志方課題組近期在Molecular Cancer雜志上發表的文章,通過全轉錄組測序、分子實驗和細胞動物表型實驗探討了hsa_circ_0004872在胃癌(GC)中的作用及其調控機制。
發表雜志:Molecular Cancer
影響因子:15.302
發表時間:2020.11.10
技術方法:全轉錄組測序、RIP-qPCR、pull down、雙熒光素酶實驗、ChIP
文章鏈接:Circular RNA hsa_circ_0004872 inhibits gastric cancer progression via the miR-224/Smad4/ADAR1 successive regulatory circuit
1. 高通量測序篩選發現hsa_circ_0004872在GC中下調
作者通過對全轉錄組測序進行circRNA分析,篩選出4個在GC中差異表達的circRNA,通過在42對組織樣品中進行qPCR驗證篩選出差異最顯著的hsa_circ_0004872,并通過sanger測序驗證了反式剪切位點處序列。作者還進一步擴大樣品量,在34對組織樣品中qPCR驗證了hsa_circ_0004872的差異表達,并通過酶耐受實驗驗證了該環狀的穩定性。
2. 細胞實驗驗證過表達hsa_circ_0004872抑制GC細胞增殖、侵襲和遷移
在GC細胞中通過構建的質粒過表達hsa_circ_0004872發現抑制了細胞的增殖、侵襲和遷移。而通過siRNA敲降hsa_circ_0004872則增加了細胞增侵襲和遷移。