那么，病毒RNA修飾的研究工作流程有哪些呢？
首先，提取病毒RNA
無論您是從細胞，組織還是病毒等樣品開始實驗，高效而快速的RNA提取通常都是成功進行實驗的第一步。工作流程的這一部分至關重要，因為足夠的純度和產量都是確保下游應用程序平穩準確運行的基本要求。
而同時，在選擇試劑盒的時候，要注意的是， 我們需要根據樣本類型來挑選：
1）病毒樣本：對于病毒樣品，諸如低病毒滴度和高污染宿主核酸的存在等挑戰要求使用補充技術來確保產量和純度符合下游實驗的要求。在我們最近的公告文章中，我們概述了完成此操作的10種方法，因此您可以將其應用到最適合您的學習的方法中。實現病毒擴增的常用方法是：接種病毒至宿主細胞，擴大培養宿主細胞進行病毒擴增，然后收集擴增的病毒體，搭配EpiGentek的病毒RNA提取試劑盒提取病毒RNA。注意：對于直接從臨床標本中提取的病毒RNA，在m6A RNA富集之前，需要去除宿主DNA和rRNA污染物。
2）細胞/組織樣本：不需要特別處理；由于可以從細胞和組織樣品中獲取大量豐富的RNA，因此不需要太多額外的處理就可以獲得足夠下游應用的RNA樣本。我們建議使用EpiGentek總RNA快速提取試劑盒或EpiQuik 磁珠法快速RNA提取試劑盒。
病毒RNA提取試劑盒
總RNA提取試劑盒
細胞核提取試劑盒
當處理細胞或組織樣本時，核提取的階段很重要。而核提取物將最終進行甲基酶或脫甲基酶活性/抑制作用的分析。 在這一步驟中，EpiQuik 核提取試劑盒可以用預裂解和裂解緩沖液處理細胞/組織，分別破壞細胞膜和核膜，并提取核蛋白以用于下游實驗。 我們的專有試劑盒含有所有核提取的試劑，可1小時的快速提取核蛋白，并可以保持完整的酶活性。
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當處理細胞或組織樣本時，核提取的階段很重要。而核提取物將最 終進行甲基酶或脫甲基酶活性/抑制作用的分析。在這一步驟中， EpiQuik核提取試劑盒可以用預裂解和裂解緩沖液處理細胞/組織，分別 破壞細胞膜和核膜，并提取核蛋白以用于下游實驗。 我們的專有試劑盒 含有所有核提取的試劑，可1小時的快速提取核蛋白，并可以保持完整 的酶活性。 |
第二步，定量m6A/5mC RNA是必不可少的：
RNA甲基化是一種可逆的翻譯后修飾，它在表觀遺傳上影響許多生物學過程，這些過程可能同時發生在病毒和非病毒來源的RNA中。其中最常見的是m6A甲基化，占所有RNA甲基化的80％以上，其次是5-mC甲基化，這可能發生在各種RNA分子中。如果您打算研究RNA中m6A或5-mC的總體甲基化水平，下表中的比色和熒光法試劑盒將會幫您快速，準確的定量。但是如果您的起始樣本是病毒，那么可能您還需要先富集和純化病毒以提高病毒RNA的產量，以適應下游實驗。因為通常情況下，因為從病毒原料中收集到的少量RNA太少而無法在下游使用。我們建議參考我們最近的文章關于關各種病毒純化方法以獲取足夠的病毒RNA量。
 | RNA甲基化是一種可逆的翻譯后修飾，它在表觀遺傳上影響許 多生物學過程，這些過程可能同時發生在病毒和非病毒來源的RNA 中。其中最常見的是m6A甲基化，占所有RNA甲基化的80％以上， 其次是5-mC甲基化，這可能發生在各種RNA分子中。如果您打算 研究RNA中m6A或5-mC的總體甲基化水平，下表中的比色和熒光 法試劑盒將會幫您快速，準確的定量。但是如果您的起始樣本是病 毒，那么可能您還需要先富集和純化病毒以提高病毒RNA的產量， 以適應下游實驗。因為通常情況下，因為從病毒原料中收集到的少 量RNA太少而無法在下游使用。我們建議參考我們最近的文章關于 關各種病毒純化方法以獲取足夠的病毒RNA量。 |