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草莓為薔薇科草莓屬，因芳香多汁、營養豐富受到喜愛，在全國各地均可種植。栽培草莓為異源多倍體，基因組復雜，雜合度高。
2019年，《自然—遺傳學》發表了利用三代測序數據組裝的高質量栽培草莓v1.0版本基因組，極大地促進了草莓和其他薔薇科植物的基因組學、分子生物學以及遺傳學研究。然而，由于基因組注釋時使用的轉錄組數據較少，仍存在注釋準確度、完整度低等問題。
近日，湖北省農科院研究團隊在《園藝研究》在線發表論文。該研究利用作者前期開發的基因組注釋流程，結合Illumina和PacBio全長轉錄組測序技術的優勢，對栽培草莓的基因組進行重注釋，顯著提升了栽培草莓基因組注釋的完整度和準確度，獲得栽培草莓基因組注釋新版本v1.0.a2。
新的基因組注釋（v1.0.a2）總共包含108,447個蛋白編碼基因，BUSCOs評估基因組完整度達到97.85%。與（v1.0.a1）注釋相比較，v1.0.a2注釋新增了360個新基因，提升了19,174個基因的結構，還為11,044個基因添加了轉錄本信息，并且搭建了草莓基因組數據庫。同時，該研究還重新分析了草莓果實發育不同時期的轉錄組數據，為草莓果實發育提供了有力的支撐。
綜上，該研究利用Illumina和PacBio測序技術對栽培草莓基因組進行重注釋，獲得了高質量的基因組注釋，為草莓的遺傳改良以及薔薇科植物的比較基因組學研究提供了重要的資源。
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