糞便是由未消化的食物、經消化后未吸收的食物殘渣與消化系統分泌物、消化道粘膜脫落物以及微生物、寄生蟲等組成的混合物。進行糞檢驗可以獲得被檢者消化系統功能、病理變化以及微生物和寄生蟲感染等廣泛的信息，具體來說，進行糞檢驗，一可以了解消化道及通向消化道的肝、膽胰等器官是否有梗阻、炎癥和出血等情況；二可以篩選和診斷消化道惡性腫瘤；三可以粗略判定胰腺的外分泌功能；四可以診斷消化系統的某些微生物和寄生蟲感染。
第一節 糞便常規檢驗方法回顧
一、目視檢查
在某些疾病情況下，糞便的顏色、性狀等有特定的顯著改變，這些肉眼可見的顯著變化具有一定的診斷意義。如在膽道梗阻時，糞便因缺乏膽色素而呈白陶土樣灰白色；上消化道出血時，大便可呈柏油樣黑而具有特殊光澤；在霍亂、副霍亂時，大便呈米泔水樣；在阿米巴腸炎時，大便往往帶有果醬樣的膿血；在腫瘤等導致下消化道出血或痔瘡出血時，大便往往帶有鮮血。另外，消化不良時，糞便含較多未消化的食物殘渣；蛔蟲、絳蟲等寄生蟲感染時，有時能從糞便中看見蟲體。
二、顯微鏡檢查
借助普通光學顯微鏡，我們可以檢出糞便標本中的脂肪小滴、血細胞、真菌、某些寄生蟲和寄生蟲蟲卵等病理成分有。發現脂肪小滴增多提示有腸蠕動亢進、腹瀉或胰腺外分泌功能減退等可能；發現大量膿細胞或白細胞，提示有菌痢等感染性腸炎；發現大量紅細胞和極少量白細胞，多提示為下消化道出血或痔瘡出血；發現大量真菌可以確診真菌性腸炎；發現寄生蟲或蟲卵可以確診該寄生蟲感染。通過電子顯微鏡，我們還可以檢出糞便標本中的某些病毒體。
三、糞便的化學檢查
常規的糞便化學檢驗主要包括糞便隱血實驗和膽紅素及其衍生物檢驗。隱血實驗主要用于消化道出血的診斷。膽紅素及其衍生物檢驗可用于嚴重腹瀉、消化道菌群大量抑制、膽道梗阻以及溶血性疾病的輔助診斷實驗。
四、大便致病菌檢驗
人類的腸道中有大量種類繁多的微生物，其中絕大部分是不致病的如：各種厭氧菌、大腸埃希氏菌和腸球菌等，只有少部分為致病微生物。大便的細菌學檢驗常規的目的就是從這些大量的微生物中分離出致病菌。
1．霍亂弧菌檢驗。霍亂在我國《急性傳染病管理條例》中列為“甲類”，其發病急，病程進展快，因此要求快速、準確報告。臨床上往往根據霍亂弧菌在革蘭氏染色中的形態及特殊的“魚群樣”排列，在暗視野下的快速運動及相應抗血清的制動實驗等進行快速的初步報告，再進行分離培養、鑒定來確診。
2．其他致病菌分離培養。目前已認識到的能從糞便中發現的病原微生物達數十種之多，如沙門氏菌屬、志賀氏菌屬、酵母菌以及致病性大腸桿菌和綠膿桿菌等。要從大便標本的大量菌群中分離這幾十種致病菌，檢驗科一般采用選擇性培養基如SS瓊脂、GN增菌液、麥康凱瓊脂等。但是目前沒有一種能用于所有致病菌的選擇培養基（事實上很難或不可能作到），因此臨床上往往采用多種選擇性培養基聯用以提高檢出率。
五、其他大便檢驗
1．大便的病毒檢驗
目前研究最多的是輪狀病毒和甲型肝炎病毒的檢驗。有研究報告指出輪狀病毒是我國嬰幼兒秋冬季節流行性腹瀉的主要致病病原，由于這種腹瀉沒有特征性的病變指標，從大便中檢出輪狀病毒就是重要的診斷依據。而糞便中甲肝病毒的檢出則是該病人具有傳染性的可靠依據。由于病毒體積微小、生命形式不完善，這使得普通顯微鏡和無生命培養基在病毒檢驗中無用武之地。可用的檢驗方法有：血清學方法、電鏡觀察與分離培養（用動物接種、組織培養、細胞培養等）等。臨床上往往采用免疫學方法進行快速診斷，且準確性和靈敏度都較高。電子顯微鏡或分離培養的方法比較費時、費事，往往在研究中采用。
2．大便寄生蟲檢驗
在目視檢查和顯微鏡檢查中，已經有大部分寄生蟲感染能被檢出。但是，由于蟲卵和蟲體在糞便中的分布高度不均一，使得目視檢查和普通的涂片鏡檢結果重復性很差。在高度懷疑寄生蟲感染的病例，應采用集卵法以及蟲卵孵化實驗等以提高檢出率和重復性。
3．大便的脫落細胞檢驗
在下消化道腫瘤時，腫瘤表面細胞會脫落并隨糞便排除，在糞便中發現腫瘤細胞可以確診某些下消化道的腫瘤。但是，由于腫瘤細胞的脫落具有隨機性，且細胞量很少、取材難，因而檢出率不高。另外，上消化道腫瘤的脫落細胞由于經過胃腸道的消化作用，難以被檢出。這使得用常規的方法進行大便脫落細胞檢驗的實用意義不大。
總的來說，大便檢驗的很多方法都已經很成熟和規范化、規程化。相關的檢驗操作及檢驗結果的臨床意義請參見《臨床檢驗操作規程》以及有關教材。本章主要介紹目前一些比較新的檢驗方法在大便檢驗中的應用及所帶來的診斷意義。