1 構筑學說
循常規設想用某一組實驗、某一篇文章探討生命奧秘和癌因是不大客觀的。若綜合多學科研究能使我們“站到巨人肩上看得遠些”并創新了思路。現有的研究成果已具備了探討生命奧秘和癌因的條件。
我國微生態奠基人魏曦教授指出［1］人們只重視致病菌的作用，而沒有重視正常菌的作用。人體有10倍于自身體細胞數1013活的微生物細胞數1014，平均每1個體細胞約有10個微生物為其服務。微生物總重約127lg、胃腸道1000g占78.6%、皮膚200g、口、肺、泌尿生殖各20g、鼻10g、眼1g。大便總量40%為微生物，其95%是活菌。他們與機體已形成相互依存、互為利益，相互協調又相互制約的統一稱微生態平衡。失衡則致病。該微生物群稱生理微生物群(NMT)。
微生態學研究［1-3］ NMT與宿主關系密切。NMT與宿主接觸愈密切，其生理作用愈明顯，愈對宿主有保護作用。外襲菌、致病菌則相反，對宿主細胞有侵襲性損害。大量電鏡片證實，NMT與上皮細胞絨毛粘附無破壞性，外襲菌、致病菌使上皮細胞及絨毛被破壞。NMT與腸粘膜緊密粘附很難分開，形成一個穩固層［4］，與上皮細胞結合為一體或插入細胞間。菌體原核細胞與真核體細胞，以各自糖須(glycocalyx)糖蛋白、糖脂多肽等具遺傳決定性物質與體細胞融為一體，二者在結構、組分及功能上已無法區分。Heine等報道［3］用15N標記細菌，90%菌體蛋白進入體細胞內，70%存在于血漿中。菌體合成的20多種氨基酸，25%的酶為宿主細胞所利用，有些酶是宿主沒有必須依賴于菌體酶如溶纖維蛋白酶等。NMT參與宿主各種營養代謝已為人們所認可。三大營養代謝，合成多種維生素尤為VitB族及VitK、D、E、A等，提供多種礦物質微量元素Cu、Ca、Zn、Mn、Mg、Se、Co等。NMT參與宿主物質、能量及基因信息的交流——三流運轉。NMT對細胞免疫及體液免疫均起重要作用。
悉生生物學研究 缺少NMT刺激的SPF生活的沒有普通動物好，也不可能存在絕對無菌的生物。SPF中樞免疫器官骨髓、胸腺、周圍免疫器官脾臟、淋巴腺發育不良；腸粘膜組織發育不良，面積縮小，重量減輕、腸壁變薄、結締組織減少，細胞數減少，網狀內皮細胞減少、漿細胞消失，潘氏盤縮小；正常柱狀細胞變成杯狀其大小形態趨一致化，腸粘膜絨毛變細、變尖及變短，杯狀細胞隨絨毛變化而模糊；細胞發生及轉化速度變慢；盲腸SPF較普通生物膨大10倍、壁變薄、上皮細胞呈現柱狀增大，絨毛增長、基底層巨噬細胞數減少，漿細胞消失；Lieberkcihn氏隱窩呈漏斗狀且變淺，在普通生物所顯正常輕度炎癥現象消失；SPF代謝率下降25%，心血流量減少40%。SPF免疫抗體減少，如IgA只有普通動物1/10，若喂食純化學無菌液體飼料則查不出IgA；血清中補體水平低、普通化后可恢復，以病毒攻激也產生干擾素等。若給SPF注射死大腸桿菌液，淋巴腺內則出現漿細胞及含丙球蛋白的細胞。若喂飼缺少Vit b及K、D飼料等，SPF則出該類物質缺乏癥。SPF不能像普通動物那樣利用礦物質微量元素，出現其代謝紊亂及缺乏癥。脂代謝障礙SPF排出含食餌性固醇類，普通動物則是由腸菌群分化的多種復雜脂肪形態。SPF腸內氮明顯減少，因NMT有將內源氮合成氨基酸及降解蛋白合成氨基酸為宿主利用的作用。
分子及亞細胞水平密切關系 生物學、免疫學、微生態學等研究［1-6］悉生生物學家P.C.Trexler指出菌群與體細胞基因，它們的增加與減少是同樣的。
質粒(Plasmid)絕大多數菌含有，它能與體細胞染色體基因組合。它是菌體染色體外有遺傳性和可變異物質。能隨體細胞染色體復制而復制，并不裂體細胞，并可遺傳給予子代。也可脫離下來獨立復制增殖一定數量細菌保持菌間數量平衡。質粒進入體細胞也將其活性代入了體細胞。一般以共價鍵閉環雙股DNA分子組合，這在結構上決定了它能與體細胞基因組合的特性，被酶切割后便與體細胞染色體組合，菌種多質粒亦多因而除同卵雙胎外極少有相同的子代，人類10萬條基因庫能否包羅還是個疑問。質粒有為適應選擇壓力而變異的特性，如在藥物生境下產生的耐藥性因子等。
噬菌體 溫和噬菌體和前噬菌體。它們有質粒如P1和轉座子如IS、Tn特性。DNA短鏈稱插入序列IS，較長稱轉座子Tn，有插入和遺傳作用。可以插入體細胞染體或質粒(細菌)進行復制，亦可引起多點突變。如大腸桿菌λ噬菌體可整合在體細胞半乳糖基因鏈上。白喉桿菌、產氣莢膜桿菌、肉毒桿菌等的毒素基因，都是以溫和噬菌體編碼與體細胞基因組合。
轉座子 有很活躍的遺傳功能，能插入染色體和質粒中，引起二者多種和多點突變，導致新種出現。
病毒 凡有細胞的地方就有病毒為微生態學提出，美國等幾所研究所采用現代技術已誘導出許多在人體細胞內潛伏的病毒——內源性病毒，如泡疹、風疹、流腦等病毒，HIV也有報道是潛在病毒。我國田波院士還在蔬菜病毒內發現了衛星核酸/病毒,控制病毒復制否，它們似有細菌的質粒、噬菌體和轉座子的作用。病毒以分子基因形式與體細胞基因組合在一起決定了它對細胞絕對依存性，也可脫軌獨立復制，但需依靠體細胞復制脫軌。病毒是NMT組成部分，微生態學講〔［-4］它們對胚胎分化細胞代謝、產生、成熟、遺傳、腫瘤發生和健康長壽有密切關系。平衡狀態不致病是主流、失衡則致病是支流、偶然是有條件的。它們在體細胞內存在和復制受超微生態規律控制(可能是病毒的衛星核酸分子)。
NMT與體細胞生命關系 生命以三流運轉形式體現，三流運轉停止、生命則停止。微生態學及生態學證實［1-3］微生物參與自然界各種生命間物質、能量及基因信息的交流——三流運轉。無機物與有機物的轉換靠微生物完成，細胞的三流運轉靠微生物完成等。因此它們在三流運轉循環中起著不能替代的重要作用，這是由生命起源所奠定的(揭奧秘之三詳)。
物流 NMT參與機體三大營養代謝、轉化各類食入性營養為體細胞所用，90%菌體蛋白、20多種菌體氨基酸、25%酶等為宿主所用。為宿主合成多種維生素、提供多種礦物質微量元素等。
能量 轉化自然能為生物能產生ATP、酶、神經遞質及激素等。
基因信息 如前述NMT以質粒、噬菌體、轉座子及病毒基因形式與體細胞基因組合。
微生態學等證明NMT與宿主“關系密切”，SPF“特征表現”表明缺乏NMT則不行。NMT與宿主細胞是細胞分子水平，以質粒、噬菌體、轉座子及病毒基因組合，在結構、組分及功能上已融為一體無法區分，證明了NMT參與構筑了體細胞，并以三流運轉形式保障機體重要的生命過程。
如上研究已明確證實了NMT參與構筑了體細胞，并以三流運轉形式保障機體重要的生命過程，因而人們發現體細胞內有腫瘤腫基因(c-onc)及病毒腫瘤基因(V-onc)，腫瘤與細胞生長有關等。臨床上發現各科疾病都能有NMT失衡等。以上多學科研究已具備了提出上述結論的條件，只是人們為細菌只有致病的概念所束縛沒能注意到NMT的生理作用。所謂“密切關系”是實際上的NMT參與體細胞的構筑關系。
2 NMT與自身免疫
著名學者Dubos1965年提出“原籍菌不會引起宿主產生抗體”的學說。本文很多研究證明NMT有抗原性，能產生抗體，而且是機體最基礎不可缺少的自身免疫。
前文論證了NMT參與構筑了體細胞，也包括免疫細胞。SPF特征表現足以證明免疫系統的發育、免疫細胞的成熟和具有免疫活性物與NMT的進入直接相關系。因此，NMT既然參與構筑了體細胞、免疫細胞，那么NMT自然是細胞的主人——自我。構筑細胞的議—NMT也就將自身生物特性代入了細胞，因而細胞所顯示的活性則是自我免疫。以NMT為自我，視除自我之外物質則為非我，自我對非我的應答所產生的則是特異性免疫。因而人們發現除免疫細胞外，紅細胞、MHCS等都具有免疫性。免疫學研究［5-6］表明在血清中能測得多種天然自身抗體，諸如肌動蛋白、肌濘蛋白、DNA、白蛋白、Ig、細胞因子及激素等自身抗體，起清除受損組織及其代謝產物維持生理自穩作用。微生態學研究［1-3］表明NMT在體內、體表、組織間、骨髓及血液等細胞內、外都有其的蹤跡。菌體蛋白90%在體細胞內，70%存在于血漿中，20多種氨基酸，25%菌體酶等為體細胞所利用。NMT與體細胞“關系密切”，在結構、組分及功能上已融為一體無法區分，各種菌體物質均有免疫原性。NMT參與機體三流運轉重要生命活動。NMT與體細胞是細胞分子水平的組合，以質粒、噬菌體、轉座子及病毒形式組合于體細胞基因上并將其生物活性“代入”體細胞。
研究證實［9-12］NMT可“活化”免疫系統。以雙岐桿菌(Bs)為例。Sekine證實［9］Bs可刺激M以下產生IL-6及IL-1，Bs完整的肽聚糖可使小鼠M產生毒性效應分子及介質，IL-1、IL-6、TNF-α等細胞因子的mRNA表達增多。Kodooka等研究［10-11］許多微生物細胞因子成分IL-1、TNF、LPS、PDGF、IFN-γ及poly(1)t和(c)等都能增強M的IL-1、IL-6的mRNA表達。G-菌的LPS有使M產生TNF的強烈作用。LT與TNF受體相同，基因系列都位于MHCS。TNF有腫瘤殺傷、活化中性粒細胞、發燒等生物活性，表明LPS是TNF的活性物質。LPS使M產生IL-1，它是一種造血因子。IL-1活化T細胞產生IL-2是細胞生長因子，IL-3是造血因子，GM-CSF粒細胞巨噬細胞集落刺激因子，IL-4細胞生長因子和IFN-γ。IFN-γ又可活化M加強LPS釋放TNF物質，可是TNF是菌體LPS釋放的物質，它可使內皮細胞(ET)和成纖維細胞(FB)產生IL-1和GM-CSF，這些都是造血因子與骨髓完成造血。LT也顯示同樣的生物活性。王立生等證明［32-33］Bs可誘發癌細胞凋亡。
NMT構筑了體細胞，并將其生物活性代入細胞，因而NMT是自我，所建立的免疫即為自身免疫，二者應答產生了特異性免疫。