箱式變電站，是當前農網改造和今后變電站建設的主要方向，但就某些方面還存在著一些不足，具體表現在：
(1)
防火問題：箱式變電站一般為全密封無人值守運行，雖然全部設備無油化運行且裝有遠方煙霧報警系統，但是箱體內仍然存在火災隱患，如：電纜、補償電容器等，一旦突發火災，不利于通風，也不利于火災的撲救，因此應考慮設計自動滅火系統，但這樣會增加箱式變電站的制造成本。
(2)
擴容問題：箱式變電站由于受體積及制造成本所限，出線間隔的擴展裕度小，如想在原箱體中再增加1～2個出線間隔是比較困難的，必須再增加箱體才能做到。
(3)
檢修問題：由于箱式變電站在制造時考慮制造成本及箱體體積所限，使箱式變電站的檢修空間較小，不利于設備檢修，特別是事故搶修，這是箱式變電站的先天不足，是無法克服的缺點。
總之，展望未來，箱式變電站在我國廣大城市、農村、工礦企業、公共建筑設施中會得到廣泛的應用，它將以其物美價廉的優點被越來越多的人們所使用，使我國的電網運行水平再上一個新臺階。