對一些氣體，如環氧乙烷的橫向靈敏度可能是個問題，因為乙烷要求一個活性好的工作電極催化和氧化的高電勢。因此，較易氧化氣體，如酒和一氧化碳。也有類似的問題。橫向靈敏度問題可通過使用化學過濾消除。例如。過濾器可使對象氣體暢通，并反應，但移去普通干擾。
盡管電化學傳感器有許多優點，但它并不適合每一種氣體。這是由于它的探測機理包括氣體的氧化或還原。雖然它可間接探測電化學惰性氣體，如這氣體和其它樣品在傳感器內反應并產生回應，但電化學氣體傳感器一般僅適用于電化學性能活潑的氣體。二氧化碳傳感器是這種接近的例子（即不能用電化學氣體傳感器測二氧化碳），它們已商品化幾年了。
