食品是人類生存的必需品和能量來源，食品安全關系到人類的身體健康和生命安全，關系到經濟健康和社會穩定，在食品生產過程中，各種食品添加劑含量過高會影響人體健康，外界環境污染也會是食品沾污，因此食品分析很重要。高效液相色譜分析法比化學分析法操作簡便，快速，融合了液相和氣相兩種分析方法的優勢，因而功效更加明顯，正在廣泛的在食品檢測工作中應用開來。
1、食品添加劑分析
食品添加劑是在食品生產加工過程中，為改善食品色、香、味等品質，以及為防腐和加工工藝的需要，而加入食品中的少量的化學合成或者天然物質。食品添加劑可以分為天然食品添加劑與化學合成食品添加劑。化學合成食品添加劑如果添加不當或者在食品中發生轉化則會對人體造成一定的危害。用高效液相色譜儀分析食品添加劑是相當成熟的方法，如梯度洗脫分析食品中的合成著色劑，等度洗脫分析食品中的防腐劑、抗氧化劑等。
2、食品營養成分分析
食物中有多種人體需要的營養成分，主要有糖、脂肪、蛋白質高、維生素、無機鹽和水六大類。根據在機體內的作用，這些營養成分可以分為構成物質、能源物質和調節物質。蛋白質、無機鹽和水是構成物質，糖和脂肪是能源物質，維生素是調節物質。
3、食品污染物分析
1983年，聯合國糧農組織和世界衛生組織食品添加劑法規委員會第十六次會議規定：凡不是有意加入食品中，而是在生產、制造、處理、加工、填充、包裝、運輸和貯藏等過程中帶入食品的任何物質都稱為污染物，但不包括昆蟲碎體、動物毛發和其他不尋常的物質;殘留農藥也算是污染物。污染物可能有：化肥、農藥、抗菌素、激素、藥物和包裝材料溶出物等。
高效液相色譜儀分離痕量金屬離子與有機試劑形成的穩定的有色衍生物，例如食品中的鋅、銅、鉛和鎘，克服了光度分析選擇性差的缺點，可實現多元素同時測定。
