1、高壓：流動相為液體，流經色譜柱時，受到的阻力較大，為了能迅速通過色譜柱，必須對載液加高壓。
2、高速：分析速度快、載液流速快，較經典液體色譜法速度快得多，通常分析一個樣品在15～30分鐘，有些樣品甚至在5分鐘內即可完成，小于1小時。
3、高效：分離效能高。可選擇固定相和流動相以達到最佳分離效果，比工業精餾塔和氣相色譜的分離效能高出許多倍。
4、高靈敏度：紫外檢測器可達0.01ng，進樣量在μL數量級。
5、應用范圍廣：百分之七十以上的有機化合物可用高效液相色譜分析，特別是高沸點、大分子、強極性、熱穩定性差化合物的分離分析，顯示出優勢。
6、柱子可反復使用：用一根柱子可分離不同化合物
7、樣品量少、容易回收：樣品經過色譜柱后不被破壞，可以收集單一組分或做制備。
