因為自動生化分析儀是模仿手工操作的過程，所以無論哪一類的自動生化分析儀，其結構組成均與手工操作的一些器械設備相似，一般可有以下幾個部分組成：
1、樣品器：放置待測樣本、標準品、質控液、空白液和對照液等。
2、取樣裝置：包括稀釋器、取樣探針和輸送樣品和試劑的管道等。
3、反應池或反應管道：一般起比色皿（管）的作用。
4、保溫器：為化學反應提供恒定的溫度。
5、檢測器：如比色計、分光光度計、熒光分光光度計、火焰光度計、電化學測定儀等。不同儀器配置不同。
6、微處理器：是分析儀的電腦部分，又叫程序控制器。控制儀器所有的動作和功能，使用者可通過鍵盤與儀器“對話”，同時電腦還能接受從各部件反饋來的信號，并作出相應的反應，對異常情況發出一定的指示信號。分析軟件和分析結果一般貯存在磁盤中，可共查詢。
7、打印機：可繪制反應動態曲線和打印檢驗報告單等。
8、功能監測器：顯示屏就是其中一部分，可查看反應狀態、人機“對話”的情況、當前儀器工作狀態、分析結果等。