質粒DNA電泳圖與基因組DNA電泳圖的區別：
1、DNA顯色帶條數：質粒DNA電泳有3條帶；而基因組DNA應該只有一條帶或者兩條帶。
2、應用技術：質粒DNA電泳圖與基因組DNA電泳圖都是采用了凝膠電泳技術。
質粒DNA電泳會有三條帶，最遠的是線形DNA（lDNA）： 質粒的兩條鏈均斷裂；線性分子；中間的是開環DNA（ocDNA）： 質粒的一條鏈斷裂；松弛的環狀分子；共價閉合環狀cccDNA： 質粒的兩條鏈沒有斷裂；超螺旋。質粒跑出來必須是三條帶，只要的是最前端的那條帶，既CCCDNA。
基因組DNA電泳一般是1條帶，雖然在你抽提過程中也會發生斷裂，形成幾十至幾百kb的大片段。但是我們一般用1%的膠，無法區分不同大小的DNA，所以看起來像是一條帶。如果配成0.6%的膠再加lamda hindIII marker，適當延長跑膠時間，就應該會出現幾條帶了。
電泳的遷移率，取決于核酸分子本身的大小和構型，分子量較小的DNA分子比分子量較大的DNA分子遷移要快些。這就是應用凝膠電泳技術分離DNA片段的基本原理。