不同生物類群對水環境有不同的指示特點。水生微生物對環境的指示快速、直接,藻類對環境的指示主要是反映中上層水體質量,低棲動物對環境的指示主要是反映下層水體和底質質量,魚類的指示主要是體現因食物鏈的富集作用而表現的毒理特征,水生植物對水環境的指示則反映水體及與水體關系密切的生長基質。