目前已有使用整體柱，納米纖維以及膜吸附替代傳統的填料顆粒的方案。對流裝置的一個明顯優勢在于其獨立性和對流量的控制能力，傳質不像傳統層析柱受到孔隙擴散的限制。薄膜擴散比孔隙擴散快的多，分離僅受到每個分子結合動力學差異（生物分子和固定相之間的親和力）的影響。但是也因為比表面積的減少，膜結合蛋白的能力比層析柱差很多（CIM-protein A monolith的載量是7.2 mg/mL，MabSelectSuRe LX 和Toyopearl AF-rProtein A的載量是100 mg/mL），但不影響對核酸、病毒和細胞的結合能力。目前工業上，膜類材質廣泛應用于初級純化和精純階段。另外將不同類型的納米顆粒（帶電的、中性的、磁性的）整合到膜結構中，可實現提高分辨率的效果。
其他吸附劑，例如磁珠，也可用于蛋白的分離過程，但是目前在大規模生產上的應用有限。不過在雙水相體系（ATPS）具有良好的應用前景。