脊髓還保留著原來神經管的模式，灰質居中央管的周圍，而白質圍于灰質的表面。脊髓的背側部分由胚胎時期神經管的翼板發展而成，主要接受感受器的傳入信息。腹側部分由基板發育而成，其功能是運動性的。腦干的顱神經核的位置按其感覺、運動的性質，基本上與脊髓的排列方式相似，但由于腦室的形狀變化，當然，不如脊髓那樣明顯而整齊。腦干中的一些既非感覺又非運動性的神經核，如紅核、橄欖核等，則位于腦干的不同部分。由于腦室及眾多的神經束和傳導束的出現，腦干的構造比脊髓要復雜得多（見表）。大腦及小腦的灰質主要分布在表層，分別稱為大腦皮層和小腦皮層；而白質則在深層。