2013值得關注的技術：納米孔測序儀

　　《Nature Methods》雜志將2012年度技術授予了定向蛋白質組學(targeted proteomics)。同時，雜志還介紹了2013年值得關注的技術，包括納米孔測序儀(Disruptive nanopores)、微生物組功能研究(Probing microbiome function)、近紅外探針(Near-infrared probes)、干細胞體外微環境(In vitro niches)等等。

　　在介紹納米孔測序儀時，《Nature Methods》使用了顛覆性(disruptive)一詞來形容納米孔。早在2007年，DNA測序技術就曾因令人驚嘆的改進而被選為當年的年度技術。到了2011年，測序技術的改進實現了大規模并行化，使得人類基因組可在單次運行中測序;Ion Torrent技術平臺不再依靠光學設備來讀取堿基，取而代之的是離子傳感;而單分子測序技術也產生了非常長的讀取。而就在這個充滿了創新的高通量測序領域，還“潛伏”著一個更具顛覆性的技術。

　　Oxford Nanopore Technologies公司在2012基因組生物學技術進展年會(AGBT)上宣布推出第一款商業化的納米孔測序儀，引起了科學界的極大關注。納米孔測序有望解決目前測序平臺的不足：讀長很長，大約在幾十kb，甚至100 kb;錯誤率目前介于1%至4%，且是隨機錯誤，而不是聚集在讀取的兩端;數據可實時讀取;通量很高(GridION有望在一天內以30倍覆蓋度測序人類基因組);起始DNA在測序過程中不被破壞;以及樣品制備簡單又便宜。

　　雜志指出，2013年我們將看到第一臺商業化的納米孔測序儀。在這臺儀器中，單條DNA鏈將穿過蛋白孔，而第二種蛋白質將控制穿過的速度。隨著堿基穿過納米孔，它們改變了電流，帶來特定的堿基組合。在理想的情況下，人們會看到每個堿基的典型模式，但目前的儀器將產生堿基三聯體特有的模式，還需要通過計算機去卷積。這些模式也不限于四種DNA堿基，納米孔測序儀還能檢測甲基化和羥甲基化的堿基，理論上，它也能直接測序RNA。

　　年底，Oxford Nanopore在美國人類遺傳學協會的年會上展示了納米孔測序儀的真機，但并未公布任何數據。也許，在2013年，我們將揭開納米孔測序儀的神秘面紗，并期待更多成果發表。