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  • 發布時間:2012-12-31 00:00 原文鏈接: 中國科學家PNAS發表基因組研究新成果

      來自軍事醫學科學院微生物流行病研究所、華大基因研究所、倫敦大學學院等研究機構的研究人員發表了題為“Historical variations in mutation rate in an epidemic pathogen, Yersinia pestis”的研究論文,解析了鼠疫耶爾森氏菌(Yersinia pestis)突變率的歷史演變。相關成果發布在《美國科學院院刊》(PNAS)上。

      軍事醫學科學院微生物流行病研究所楊瑞馥研究員和宋亞軍博士、華大基因研究所的王俊博士,以及倫敦大學學院的Francois Balloux是這篇論文的共同通訊作者。

      鼠疫(plague)是鼠疫桿菌借鼠蚤傳播為主的烈性傳染病系廣泛流行于野生嚙齒動物間的一種自然疫源性疾病。臨床上表現為發熱、嚴重毒血癥癥狀淋巴結腫大、肺炎、出血傾向等。鼠疫在世界歷史上曾有多次大流行,在3個有記載的大流行期間導致了大約2億人死亡,因此被冠上“最具毀滅性傳染病”的名頭。鼠疫耶爾森氏菌是鼠疫的病原體,過去的研究表明其由于起源較近,遺傳多樣性非常有限。

      在這篇文章中,研究人員解析了鼠疫耶爾森氏菌突變率的歷史演變。對來自中國和其他地方的133個鼠疫耶爾森氏菌基因組進行了分析,鑒別出了2,326個單核苷酸多態性(SNPs)。這些SNPs確定了從最近的共同祖先開始鼠疫耶爾森氏菌的系譜。這些SNPs中有28個作為突變只在系譜中發生過一次,基本上隨機分布在單個基因之間。只有7個基因有明顯過量的非同義SNP,表明SNPs的固定(fixation)主要是通過遺傳漂移等中性演變,而非達爾文選擇進化產生。然而,整個系譜固定率差異很大:不同譜系累積的SNPs數量高度變化,系譜中包含了多分類,其中一個導致了黑死病(Black Death)時間相近的4個分支。

      研究結果表明人口結構變化可以影響傳染病病原體的進化速度,即便在沒有自然選擇的情況下,并推測在間歇性疾病流行和爆發的過程中,中性SNPs被快速固定。

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