低密度脂蛋白膽固醇與體內另一種與膽固醇轉運相關的脂蛋白——高密度脂蛋白膽固醇（High Density Lipoprotein Cholesterol，HDL-C）相對應。
高密度脂蛋白為血清蛋白之一。縮寫為HDL。富含磷脂質，可輸出膽固醇促進膽固醇的代謝，它運載周圍組織中的膽固醇，再轉化為膽汁酸或直接通過膽汁從腸道排出，動脈造影證明高密度脂蛋白膽固醇含量與動脈管腔狹窄程度呈顯著的負相關。所以高密度脂蛋白是一種抗動脈粥樣硬化的血漿脂蛋白，是冠心病的保護因子。
低密度脂蛋白是富含膽固醇的脂蛋白，其膽固醇主要來自從CE轉運的高密度脂蛋白中的膽固醇。
高密度脂蛋白膽固醇和低密度脂蛋白膽固醇是人體中常見的兩種膽固醇。前者能將血管中的血脂運到肝臟中處理掉，有效防止心臟病和其他心血管疾病，因而被稱為“好膽固醇”；而低密度脂蛋白膽固醇會把肝臟中的血脂運到血管里，誘發疾病，被稱“壞膽固醇”。
低密度脂蛋白是膽固醇的攜帶者，向組織運送膽固醇，高密度脂蛋白是轉化者。低密度脂蛋白高直接促進動脈粥硬化的形成。
