冠狀病毒直徑約60-220nm，病毒內包含正向的單鏈RNA，單鏈的RNA長度約27到32kb，分為兩大組成部分：復制酶編碼區和結構蛋白編碼區。
復制酶編碼區主要表達編碼兩個大基因，ORF1a和ORF1b，它們編碼16個非結構蛋白（nsp1-nsp16），在整個冠狀病毒中高度保守（圖1A）。結構蛋白編碼區主要編碼冠狀病毒四個結構蛋白：刺突糖蛋白（Spike Protein，S），是受體結合位點；包膜糖蛋白（Envelope Protein，E），幫助病毒進入宿主細胞；膜糖蛋白（Membrane glycoprotein，M），負責營養物質的跨膜運輸、新生病毒的出芽釋放；核衣殼蛋白（Nucleocapsid protein，N），保護RNA的穩定性（圖1B） 。
改自Cui J, Li F, Shi ZL (2019). Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. Nat Rev Microbio. 17(3):181-192.