需與結核性腦膜炎、化膿性腦膜炎、流行性乙型腦炎、流行性腮腺炎、脊髓灰質炎、柯薩奇及埃可病毒等所致中樞神經系統感染等鑒別。
1.流行性乙型腦炎
流行季節為夏秋季，發病年齡主要是10歲以下兒童，發病地區主要在溫帶及亞熱帶，臨床表現急性期以肌張力升高、強直性痙攣多見，一般不出現弛緩型癱瘓和肌肉萎縮。
2.脊髓灰質炎
多見于幼兒，一般是肢體弛緩性癱瘓，而頸肌、肩胛肌癱瘓使頭下垂者少見，鮮有意識障礙。
3.感染性多發性神經炎
亦可出現肌肉弛緩性癱瘓，但一般呈對稱性，且常伴有感覺障礙。
