1.提供機體能量 輔酶A是體內70多種酶反應通路的輔助因子，包括糖類的分解，脂肪酸的氧化，氨基酸的分解，丙酮酸的降解，激發三羧酸循環，提供機體生命所需90%的能量。
2.提供活性物質 輔酶A參與機體大量必需物質的合成。在腦部合成神經肌肉信使和神經遞質乙酰膽堿以及促進睡眠的褪黑激素（melatonin）等。神經肌肉信使可在神經和肌肉之間交換資訊，神經遞質可在神經和大腦之間傳遞情感、外界刺激、記憶、學習等方面的資訊。
3.傳遞酰基作用 輔酶A是重要的乙酰基和酰基傳遞體。
4.激活免疫作用 輔酶A支持機體免疫系統對有害物質的解毒、激活白細胞、促進血紅蛋白的合成、參與抗體的合成。
5.促進結締組織形成和修復 輔酶A能促進結締組織成分硫酸軟骨素和透明質酸的合成，對軟骨的形成、保護和修復起重要作用。
6.其他作用 輔酶A促進輔酶Q10和輔酶I的利用，減輕抗生素及其他藥物引起的毒副作用。