正常成人每日在骨髓內生成大量的中性粒細胞，約1011個以上。集落刺激因子IL-3、GM-CSF能促使G0期造血干細胞進入細胞增殖周期，在骨髓增殖池G-CSF特異地誘導粒系祖細胞進一步地增殖和分化。晚幼粒細胞停止了增殖，繼續分化成熟為桿狀核和中性分葉核細胞。這些細胞在進入周圍血液前可在骨髓貯存池內逗留5天左右。由于某些致病因素直接損傷骨髓導致CFU-GM數量或質的異常或使造血功能障礙，那么粒細胞缺乏癥病因有哪些？
1、 藥物引起的損傷：抗腫瘤藥物和免疫抑制劑都可直接殺傷增殖細胞群。藥物抑制或干擾粒細胞核酸合成，影響細胞代謝，阻礙細胞分裂。藥物直接的毒性作用造成粒細胞減少與藥物劑量相關。其它多類藥物亦可有直接的細胞毒性或通過免疫機制使粒細胞生成減少。
2、化學毒物及放射線：化學物苯及其衍生物、二硝基酚、砷、鉍等對造血干細胞有毒性作用。X線、γ線和中子能直接損傷造血干細胞和骨髓微環境，造成急性或慢性放射損害，出現粒細胞減少。
3、免疫因素自身免疫性粒細胞減少：是自身抗體、T淋巴細胞或自然殺傷細胞作用于粒系分化的不同階段，致骨髓損傷阻礙粒細胞生成。常見于風濕病和自身免疫性疾病時。某些藥物為半抗原進入敏感者體內與粒細胞膜蛋白結合或與血漿蛋白結合成全抗原吸附于粒細胞表面。這些全抗原刺激機體產生相應的抗粒細胞抗體IgG或IgM。當重復用藥時引起粒細胞凝集和破壞。這稱之為免疫性藥物性粒細胞缺乏癥。有部分患者對某些藥物（磺胺、解熱鎮痛藥、抗生素等）產生過敏反應，除導致粒細胞減少外，還常伴有皮疹、蕁麻疹、哮喘、水腫等過敏表現。引起免疫性粒細胞減少者與用藥劑量無關。
4、全身感染：細菌感染如分支桿菌（特別是結核桿菌）及病毒感染如肝炎病毒等。
5、異常細胞浸潤骨髓：癌腫骨髓轉移、造血系統惡性病及骨髓纖維化等造成骨髓造血功能的衰竭。
6、細胞成熟障礙--無效造血：如葉酸和維生素B12缺乏，影響DNA合成。骨髓造血活躍，但細胞成熟停滯而破壞于骨髓內。某些先天性粒細胞缺乏癥和急性非淋巴細胞白血病、骨髓異常增生綜合征、陣發性睡眠性血紅蛋白尿也存在著成熟障礙，而致粒細胞減少。