肺炎鏈球菌是人體鼻咽部的正常菌群，當機體免疫力下降或獲得新血清型時可引起侵襲性疾病。肺炎鏈球菌敗血癥可繼發于肺炎鏈球菌性肺炎、中耳炎、乳突炎、咽炎，病菌大多由肺部經引流淋巴徑路經胸導管入血，中耳炎及乳突炎時則肺炎鏈球菌可經靜脈竇入血，肺炎鏈球菌肺炎患者中，20%～30%血培養陽性，陽性率隨年齡增長而增加。脾切除患者發生較多，可能與脾臟的單核-吞噬細胞系統具有強大的吞噬與殺滅有莢膜的肺炎鏈球菌的功能有關。其他原有重癥疾病（如鐮狀細胞貧血及免疫功能低下）患者，均易發生肺炎鏈球菌敗血癥。
