腎結石的形成過程是某些因素造成尿中晶體物質濃度升高或溶解度降低，呈過飽和狀態，析出結晶并在局部生長、聚積，最終形成結石。影響結石形成的因素很多，年齡、性別、種族、遺傳、環境因素、飲食習慣和職業與結石的形成相關。機體的代謝異常（如甲狀旁腺功能亢進、皮質醇增多癥、高血糖）、長期臥床、營養缺乏（維生素B6缺乏、缺鎂飲食）、尿路的梗阻、感染、異物和藥物的使用是結石形成的常見病因。已經知道泌尿結石有32種成分，最常見的成分為草酸鈣，其他成分的結石如磷酸銨鎂、尿酸、磷酸鈣以及胱胺酸（一種氨基酸）等。腎結石很少有單純一種晶體組成，大多有兩種或兩種以上，而以一種為主體。