Meckel憩室無并發癥時，無臨床癥狀。當發生并發癥時，可出現各種不同的癥狀。
1.腸梗阻
可因憩室向回腸腔內翻轉，形成腸套疊；若以臍帶為軸心旋轉，可發生小腸扭轉；由于憩室纖維帶與腹壁或腹腔內臟器相連，可壓迫小腸形成腸梗阻；憩室還可嵌頓于疝囊內。以上各種因素均可引起腸梗阻，出現惡心、嘔吐、腹痛、腹脹等癥狀。
2.憩室出血
胃黏膜、胰腺組織可迷走于憩室內，引起潰瘍性出血，約占30%。發病時突然出現大量便血，大便呈鮮紅色或暗紅色，患者可出現面色蒼白、口渴、煩躁不安等休克癥狀。
3.憩室炎
出現右下腹疼痛、壓痛、腹肌緊張，不易與闌尾炎鑒別，還可伴有嘔吐、發熱、血白細胞計數增高等。但憩室炎所致的炎性體征偏于腹中部，腹瀉的機會較多，大便中可能帶有膿血。
4.憩室穿孔
憩室的炎癥和潰瘍均可導致憩室穿孔。穿孔大多急性發作，表現為劇烈腹痛、嘔吐和發熱。腹部檢查有腹膜炎體征，少數病例膈下有游離氣體。