治療包括對磷的潴留和高磷血癥的控制、對低鈣血癥的糾正、活性維生素D的應用、透析鈣含量的控制、經皮甲狀旁腺內注射無水酒精或骨化三醇（二羥膽骨化醇）、甲狀旁腺次全切除等。
1.控制磷的潴留和高磷血癥
（1）限制飲食中磷的攝入 每天攝入量不超過600～900mg，對于GRF為30～60ml/min患者至為重要。應注意避免食用含磷較多的食物，如黃豆、紫菜等
（2）應用磷結合劑 在限制磷攝入不滿意而血磷增高時，應使用磷結合劑，可使唾液、膽汁和腸液中的磷轉換為不能吸收者，進食含磷食物過多（>2.0g/d）可能減低磷結合劑的作用。常用的磷結合劑有氫氧化鋁、鈣制劑（碳酸鈣，醋酸鈣）及鎂制劑。如氫氧化鋁、醋酸鈣和碳酸鈣、鹽酸鑭等。
2.糾正低鈣血癥
低鈣血癥時應長期補鈣，可提高血鈣濃度，降低血清堿性磷酸酶和甲狀旁腺素。
如果有嚴重的高磷血癥，補鈣會增加鈣磷乘積，導致軟組織鈣化，因此，應先使用氫氧化鋁等，磷結合劑使血磷降到<1.77mmol/L才補鈣。
補充適量鈣劑可糾正低血鈣，大量補鈣則可導致高鈣血癥而引起異位性軟組織鈣化，尤其與維生素D制劑合用時。因此，使用鈣劑時必需嚴密觀察血鈣濃度，特別對于接受血透治療者更為重要。
3.骨化三醇的應用
二羥膽骨化醇缺乏是導致繼發性甲旁亢最重要的原因，當GFR下降到低于40ml/min時，二羥膽骨化醇水平即開始下降，終末期腎衰時顯著減少，有功能的腎組織的減少和早期高磷血癥對二羥膽骨化醇的抑制均參與了二羥膽骨化醇合成的減少，此時宜用骨化三醇或其他類似制劑治療，但在治療以前，必須將高磷血癥基本控制，否則骨化三醇能促進腸道內磷的吸收而加重高磷血癥。
4.透析前病人骨化三醇的應用
透析前腎衰繼發性甲狀旁腺功能亢進病人是否需要使用骨化三醇還沒有定論。過去有人擔心應用骨化三醇可能通過引起高鈣血癥、高磷血癥和高尿鈣癥而加速腎功能的喪失。但是有些報道說明，只要避免高鈣血癥的發生，使用骨化三醇通常不引起腎功能的變化。因此，小劑量的骨化三醇似乎是安全的，而且能有效地降低甲狀旁腺素的分泌。
5.二羥膽骨化醇類似物
6.鈣敏感受體增效劑
另外一種能降低甲狀旁腺素又能減少高鈣血癥的方法是用激活甲狀旁腺內的鈣敏感受體的鈣模擬物。
7.經皮注射無水酒精或骨化三醇
綜上所述，骨化三醇及其類似物治療繼發性甲狀旁腺功能亢進是一種首選的方法。
8.透析液的鈣含量
透析用水必須凈化，使用反滲水。透析液中的鈣為離子鈣，可以自由通過透析膜，而血鈣中只有60%的離子鈣。透析過程中血鈣可以丟失，也可以增加，取決于透析液和血液中鈣的濃度、透析液中含鈣量和血液中可以擴散鈣的濃度。使用低鈣透析液還有一個優點，可以讓病人口服較大劑量的鈣，以便更好地與磷結合而降低血磷。但是，如果沒有口服補鈣，則不宜使用低鈣透析液，以免加重低鈣血癥和甲狀旁腺功能亢進。
9.甲狀旁腺次全切除術
在下列情況下可考慮作甲狀旁腺次全切除術：血漿甲狀旁腺素顯著升高（常>1000pg/ml）；持續性高鈣血癥；嚴重的皮膚瘙癢經充分血透無效；有明顯的軟組織鈣化；纖維性骨炎經保守治療無效；軟組織缺血性病變，發生潰瘍或壞死者。
