根據患者的連續咽部不適感3個月以上的病史，結合患者咽部黏膜慢性充血，小血管曲張，呈暗紅色，表面有少量黏稠分泌物或咽后壁多個顆粒狀濾泡隆起，呈慢性充血狀，咽側索淋巴組織增厚呈條索狀，或咽黏膜干燥、菲薄，覆蓋膿性干痂，可診斷慢性咽炎，但應注意許多全身性疾病（特別是腫瘤）的早期可能僅有與慢性咽炎相似的癥狀。故當主訴與查體所見不吻合或有其他疑點時，不應貿然單純診斷慢性咽炎，而必須詳細詢問病史，全面仔細檢查鼻、咽、喉、氣管、食管及頸部甚至全身的隱匿性病變，以免漏診。慢性變應性咽炎的診斷，除有相應的變應原接觸史、相應的癥狀及體征外，還應做皮膚變應原試驗，總IgE及血清特異IgE檢測以明確其過敏原。慢性反流性咽炎可行胃食管反流相關檢查。
