功能性消化不良屬中醫的“脘痞”、“胃痛”、“嘈雜”等范疇。其病在胃，涉及肝脾，病機主要為脾胃虛弱、氣機不利、胃失和降。正常生理情況下脾主運化，胃主受納，脾主升而胃主降，脾喜燥而惡濕，胃喜濕而惡燥，在五行屬土。肝主疏泄、性喜條達，在五行屬木，長期情志失調，抑郁不舒，使肝氣郁結，疏泄失司，肝木克土，脾胃失和；暴飲暴食，過食生冷，食谷不化，痰濕困阻，脾氣不升，胃氣不降；脾胃素虛或勞倦傷脾，脾胃氣虛，中焦不運，水谷不化，聚成痰濕，進而使中焦氣機升降失常；脾胃虛弱，健運失司，水反為濕，谷反為滯，濕滯久郁化熱，寒熱互結胃脘。以上終致胃腸運動功能紊亂，上則胸悶哽咽，中則胃脘脹痛，下則大便秘結；胃氣不降反升，則噯氣反酸，嘔吐燒心等；脾氣不升反降，則中氣下陷，出現胃脘墜脹，納呆早飽，大便自利不禁。所以在治療功能性消化不良時，注意健脾和胃，疏肝理氣，使脾氣得升，胃氣得降，肝氣得舒，病則得治。
1.肝氣犯胃型
由于當今社會競爭激烈，生活節奏加快，工作學習壓力加大，精神緊張，情志抑郁，易致肝氣郁結，橫逆犯胃，脾胃受傷，受納和運化水谷功能障礙，導致胃腸功能紊亂。癥見：胃脘脹痛，脘痛連脅，胸脘痞滿，納呆噯氣，喜嘆息，煩躁易怒，或焦慮不寐，隨情志因素而變化，舌苔薄白，脈弦。治宜疏肝理氣、化滯消痞。
2.飲食停滯型
由于人民生活水平的提高，人們往往易暴飲暴食，嗜食肥甘厚膩，損傷脾胃，中焦氣機阻塞，健運失司，腐熟無權。癥見：脘腹脹滿，噯腐吞酸、納呆惡心，或嘔吐不消化食物，舌苔厚膩，脈滑。治以消食導滯、和胃降逆。
3.脾胃虛弱痰濕停止型
素體脾胃虛弱，或由于各種原因日久損傷脾胃致脾胃虛弱，納運無力，痰濕滯留中焦，脾氣不升，胃氣不降，氣機逆亂。癥見：胃脘痞滿，餐后早飽，噯氣，不思飲食，口淡無味，四肢乏力沉重，常多自利，舌苔白膩，脈沉濡緩。治宜健脾益氣、和胃化濕。
4.寒熱互結、氣不升降型
由于誤用下劑，損傷中陽，外邪乘機而入，或濕滯日久化熱，寒熱互結，氣不升降。癥見：胃脘痞滿不痛，灼熱嘈雜吞酸，口苦，腸鳴泄瀉，舌苔薄黃而膩，脈弦數。治宜辛開苦降、和胃消痞。