積極治療后本病預后良好,淋巴結干酪樣變可逐漸被吸收、硬結鈣化而自愈。慢性中毒癥狀可存在很長時間才消失。淋巴結干酪壞死液化,破潰到腹腔或腹壁外形成瘺管長期不愈,這種病例稱腸系膜結核,現已極少見。合并腹膜炎及腸結核時,預后與兩病有直接關系。