(1)后顱凹探查術：對小腦半球和橋小腦角的蛛網膜粘連和囊腫進行剝離和切除，可收到一定效果。對中線型第四腦室正中孔和小腦延髓池的粘連和囊腫可行剝離和切除，并使中孔開放。如枕大池廣泛粘連影響腦脊液循環吸收，可先行枕肌下減壓術，以后再考慮做腦室腹腔分流術。
(2)視交叉部探查術：視交叉部蛛網膜炎視力減退和視野缺損，經積極對癥治療不見好轉甚至不斷惡化時，可施行粘連與囊腫分離和切除。按常規垂體手術入路，最好在手術顯微鏡下小心地分離視神經和視神經交叉部的蛛網膜粘連，切除絞窄性的纖維帶和壓迫性的蛛網膜囊腫，使視神經和視交叉部得到緩解，但不可強行分離，以免增加損害。一般有效率大約30%～40%，故術后仍應繼續各種綜合治療。
(3)幕上開顱探查術：大腦凸面蛛網膜炎經過長期的綜合治療，癥狀無好轉，相反有進行性的顱內壓增高和視力逐漸減退、有失明危險者，可開顱分離粘連和切除囊腫，應用雙側顳肌下減壓或去骨瓣減壓，常可使顱內壓力得到緩解，視力獲得穩定或好轉。
(4)對不典型的彌漫性腦蛛網膜炎出現較明顯的梗阻性或交通性腦積水時，均可先行腦室腹腔分流術，術后繼續前述非手術療法。