HCV基因分型還無統一標準，因用于基因分型的部位和采用的技術方法不同，出現了各種基因分型結果，但各種基因型分類方法之間有一定的對應關系，茲舉幾種基因型分類法供參考。
HCV基因型各種分型之間的對應關系
現知歐美國家多數HCV-Ⅰ型感染，而亞洲國家以Ⅱ型為主，Ⅲ型次之。Okomoto報告日本慢性丙型肝炎患者和健康獻血員主要為Ⅱ型感染，分別占59.3%和82.4%,而血友病人約50%為Ⅰ型感染,原因是應用輸入美國進口凝因子Ⅷ。Wang氏報告我國北京慢性丙型肝炎患者86.2%為Ⅱ型感染,Ⅲ型感染為13.8%。而新疆病人Ⅲ型感染卻占50%,說明不同型HCV具有一定的地區和人群分布特征。此外不同基因型感染引起臨床過程和干擾素治療反應亦表現不同,如Ⅲ型感染臨床癥狀較重,有引起嚴懲肝病傾向:Ⅱ型(Simmonds 1b)感染對干擾素治療不敏感效果差，Ⅲ型感染(Simononds 2a)用干擾素治療效果好。