1.侵襲性疾病主要引起化膿性炎癥。葡萄球菌可通過多種途徑侵入機體，導致皮膚或器官的多種感染，甚至敗血癥。
（1）皮膚軟組織感染主要有癤、痛、毛囊炎、膿痤瘡、甲溝炎、麥粒腫、蜂窩組織炎、傷口化膿等。
（2）內臟器官感染如肺炎、膿胸、中耳炎、腦膜炎、心包炎、心內膜炎等，主要由金葡菌引起。
（3）全身感染如敗血癥、膿毒血癥等，多由金葡菌引起，新生兒或機體防御可能嚴重受損時表皮葡萄球菌也可引起嚴重敗血癥。
2.毒性疾病由金葡菌產生的有關外毒素引起
（1）食物中毒 進食含腸毒素食物后1～6小時即可出現癥狀，如惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉，大多數病人于數小時至1日內恢復。
（2）燙傷樣皮膚綜合征多見于新生兒、幼兒和免疫功能低下的成人，開始有紅斑，1～2天有皮起皺，繼而形成水皰，至表皮脫落。由表皮溶解毒素引起。
（3）毒性休克綜合征 由TSST1引起，主要表現為高熱、低血壓、紅斑皮疹伴脫屑和休克等，半數以上病人有嘔、腹瀉、肌痛、結膜及粘膜充血，肝腎功能損害等，偶爾有心臟受累的表現。
（4）假膜炎腸炎本質是一種菌群失調性腸炎，病理特點是腸粘膜被一層炎性假膜所覆蓋，該假膜由炎性滲出物、腸粘膜壞死塊和細菌組成。人群中約10～15%有少量金葡菌寄居于腸道，當優勢菌如脆弱類桿菌、大腸肝菌等因抗菌藥物的應用而被抑制或殺滅后，耐藥的金葡菌就乘機繁殖而產生毒素，引起以腹瀉為主的臨床癥狀。