探針有DNA探針和寡核苷酸探針。
探針標記方法有：隨機引物標記、切口平移法、末端標記法。
切口平移是切口產生3'羥基和5'磷酸基團，DNA延伸合成3'端，5'端被小片段降解，缺口位點沿著雙鏈向3'端移動，是在體外向DNA分子引入放射性標記核苷酸的技術。
隨機引物合成是使寡核苷酸引物與DNA模板結合，在Klenow酶的作用下，合成DNA探針。
末端標記法通過末端脫氧核糖核苷酸轉移酶催化標記的dNTP加到單鏈或雙鏈DNA的3，末端上。
探針合成的注意事項
①合成探針的長短，一般在20~50個核苷酸之間。合成過長成本高，且易出現聚合酶合成錯誤，雜交時間長，合成太短則特異性下降。
②堿基組成G-C應含40%~60%，一種堿基連續重復不超過4個，以免非特異性雜交產生。
③探針自身序列內應無互補區域，以免產生“發夾”結構，影響雜交。
總之，一個好的探針最終要在實踐中才能加以確認。
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