臨床表現復雜，常見3種類型：過敏性支氣管肺曲霉病（多見過敏體質）、曲霉球（最常見癥狀是咯血）和侵襲性肺曲霉病（為粒細胞缺乏或接受廣譜抗生素、激素、免疫抑制劑治療過程中出現不能解釋的發熱、干咳、胸痛，咯血等）。過敏性支氣管肺曲霉病診斷標準包括：
（1）反復哮喘樣發作；
（2）外周血嗜酸粒細胞增高≥1X109/L；
（3）X線一過性或游走性肺部浸潤；
（4）血清總IgE濃度≥1000mg/ml；
（5）曲霉抗原皮試陽性；
（6）血清沉淀素抗體陽性；
（7）特異性抗曲霉IgE和IgG滴度升高；
（8）中央囊狀支氣管擴張。
肺曲霉球根據影像學特征可作出臨床診斷，但需與其他真菌球、錯構瘤、肺癌、棘球蚴囊腫、肺膿腫相鑒別。確診需病原學和組織病理學。肺曲霉球CT特征為肺空洞或胸膜腔內圓形致密陰影，其邊緣有透光暈影。若空腔較大，尚可見球形陰影有蒂與洞壁相連，形如鐘擺，球形陰影可隨體位變化而改變形態。如果空洞較小，球形病灶填充了大部分空腔，其暈影很小，僅呈一狹長的半月形透亮帶。侵襲性肺曲霉病CT特征：早期為炎癥陰影，周圍呈現薄霧狀滲出（“暈輪征”），隨后炎癥病灶出現氣腔實變，可見支氣管充氣征，再后可見病灶呈現半月形透光區（“空氣半月征”），進一步可變為完整的壞死空洞。其診斷采用上述提到的3級診斷標準。GM試驗陽性提供重要參考。