伯克霍爾德菌屬內大部分菌種分離自土壤、水和動植物中，只有少數幾個種與人類感染相關，其中臨床最多見伯克霍爾德菌通常指由7個基因型組成的洋蔥伯克霍爾德菌復合群，屬內還有假鼻疽伯克霍爾德菌、鼻疽伯克霍爾德菌等。
鼻疽伯克霍爾德菌是鼻疽病的病原菌，假鼻疽伯克霍爾德菌是假鼻疽病的病原菌，均主要引起牲畜疾患，主要流行于熱帶和亞熱帶地區。假鼻疽伯克霍爾德菌和鼻疽伯克霍爾德菌為潛在的生物恐怖細菌，易感染貓、狗和馬等動物，人類可通過傷口、黏膜、呼吸道途徑而獲得感染。急性患者可有高熱、衰竭等全身癥狀，病菌進入血流，可形成菌血癥及內臟膿腫，最后常因膿毒血癥死亡。
洋蔥伯克霍爾德菌存在于土壤及水中，在醫院環境中常污染自來水、體溫表、噴霧器、導尿管等，引起多種醫院感染，包括敗血癥、心內膜炎、肺炎、傷口感染、膿腫等；洋蔥伯克霍爾德菌也是引起囊性纖維化及慢性肉芽腫患者感染的最重要條件致病菌。