藍氏賈第鞭毛蟲病是由于感染蟲體對機體產生的機械和化學作用，導致機體產生非特異性和特異性宿主反應。分布呈世界性，在前蘇聯特別嚴重，美國也接近于流行，發展中國家感染人數約為2.5億。中國分布也很廣泛，各地感染率0.48%～10%之間，兒童高于成人，夏秋季節發病率較高。
人體感染后出現以腹瀉為主的吸收不良綜合征，腹瀉呈水樣糞便，量大、惡息、無膿血。兒童患者可由于腹瀉，引起貧血等營養不良，導致生長滯緩的疾病。若不及時治療，多發展為慢性，表現為周期性稀便，反復發作，大便甚臭，病程可長達數年。
