1.原發性肺芽生菌病
由呼吸道吸入真菌孢子引起肺泡炎，巨噬細胞浸潤、中性粒細胞浸潤，形成膿腫及肉芽腫性損害。癥狀包括干咳、胸痛、低熱和呼吸障礙。多數病例可自愈。
2.慢性皮膚及骨骼芽生菌病
好發于暴露部位如顏面、手、腕、下肢或皮膚黏膜交界區，如口、咽、舌等處，也可位于非暴露部位。起初表現為丘疹或膿皰，逐漸擴大形成暗紅色疣裝斑片或皮下結節，邊緣高起1～3cm，界限清楚，其中有紫色結痂，可轉為潰瘍。常誤診為基底細胞癌，但邊緣常有微膿腫，壓之有膿液排出，潰瘍纖維化后形成瘢痕，潰瘍中央活檢常查不到菌而在活動邊緣才可查到。
部分患者可出現骨芽生菌病，以骨溶解和單關節炎為表現，發生于脊椎、肋骨、頭骨和長骨。
3.系統性皮炎芽生菌病
多數從肺，少數從其他部位通過血液循環播散至骨骼、肺、皮膚、腦等部位，消化道則很少累及，其中骨受累最常見，脊椎、肋骨、脛骨和股骨常累及，表現為骨髓炎，骨膜炎甚至化膿性關節炎，有疼痛和功能障礙。皮膚和內臟受累表現為多發性膿腫，內臟可累及肝、脾、腎、腦。前列腺等