血清溶菌酶測定對鑒別各型急性白血病有一定意義,急粒與急單血清溶菌酶升高；而急淋、急性紅白血病降低或正常；經化療奏效病情緩解后,溶菌酶水平可恢復。血清溶菌酶測定可作為判斷局限性腸炎活動性的一個有用的指標,并且有助于判斷臨床過程的嚴重程度和對治療的反應。
尿液溶菌酶含量增高的原因有：
①腎小管損害；
②高溶菌酶血癥；
③腎組織破壞。
臨床上測定尿液溶菌酶主要是作為腎小管損害的一個指標,各種原因的腎小管損害都可引起尿溶菌酶含量增高。腎移植患者定期檢查尿溶菌酶活性十分必要。如移植腎接受良好,則溶菌酶活性在7天內恢復正常；若尿中過多的溶菌酶持續存在,必須疑及排斥反應的發生。
細菌性腦膜炎患者腦脊液(CSF)溶菌酶含量遠較病毒性腦膜炎患者的含量高。因此,用溶菌酶測定對二者的鑒別有重要意義。此外。CSF溶菌酶測定對中樞神經系統的原發性或繼發性腫瘤有一定輔助診斷價值。
慢性支氣管炎患者痰液中溶菌酶含量降低；重癥肺結核、泌尿系統感染患者血清或尿液中溶菌酶活性均可顯著升高。此外,溶菌酶含量測定亦可作為判斷局限性腸炎活動性指標。并有助于對臨床過程的嚴重程度和治療反應進行評價。