水性聚氨酯樹脂制備中常用的低聚物多元醇一般以聚醚二醇、聚酯二醇居多，有時還使用
聚醚三醇、低支化度聚酯多元醇、聚碳酸酯二醇等低聚物多元醇。聚醚型聚氨酯的柔順性、耐水性較好，常用的聚氧化丙烯二醇(PPG)的價格比聚酯二醇的低，因此我國的水性聚氨酯研究開發大多以聚氧化丙烯二醇為主要原料。由聚四氫呋喃醚醇制得的聚氨酯力學性能及耐水解性均較好，但其價格相對較髙，限制了它的廣泛應用。
聚酯型聚氨酯強度高、黏結力好，但由于聚酯本身耐水解性能比聚醚的差，故采用一般原料制得的聚酯型水性聚氨酯，其儲存穩定期較短。國外的聚氨酯乳液及涂料的主流產品是聚酯型的。脂肪族非規整結構聚酯的柔順性也較好，由規整結構的結晶性聚酯二醇制備的單組分聚氨酯乳液黏合劑，膠層經熱活化黏結，初始強度較高。而芳香族聚酯多元醇制成的水性聚氨酯對金屬、PET等材料的黏結力高，內聚強度大聚碳酸酯型聚氨酯耐水性、耐候性、耐熱性好，但易結晶，價格髙，應用受到限制。