包括分散在全身各器官組織中的巨噬細胞、單核細胞及幼稚單核細胞。共同起源于造血干細胞，在骨髓中分化發育，經幼單核細胞發育成為單核細胞，在血液內停留12～102小時后，循血流進入結締組織和其他器官，轉變成巨噬細胞.
單核吞噬細胞系統的細胞，有骨髓中的定向干細胞、原單核細胞、幼單核細胞，血液內的單核細胞和多種器官中的巨噬細胞。后者包括結締組織的巨噬細胞，肝的Kupffer細胞，肺的塵細胞，淋巴結和脾的巨噬細胞，胸膜腔和腹膜的巨噬細胞，神經組織的小膠質細胞以及骨組織的破骨細胞等。它們的特點是均來源于血中的單核細胞，細胞核為單個，細胞膜表面具有抗體和補體的受體，有活躍的吞噬作用等。
