從參與促進一個反應而本身不在最終產物中出現這一點來看，分子伴侶具有酶的特征。但從以下三方面來看，分子伴侶和酶很不同。
1、分子伴侶對靶蛋白沒有高度專一性，同一分子伴侶可以促進多種氨基酸序列完全不同的多肽鏈折疊成為空間結構、性質和功能都不相關的蛋白質。
2、它的催化效率很低。行使功能需要水解ATP，以改變其構象，釋放底物，進行再循環。
3、它和肽鏈折疊的關系，是阻止錯誤折疊，而不是促進正確折疊。
4、多能性（脅迫保護防止交聯聚沉，轉運，調節轉錄和復制，組裝細胞骨架）
5、進化保守性
