（1）透析失衡綜合癥：發生率為3.4%～20%。血液透析的副作用主要表現為惡心、嘔吐、煩躁不安等，嚴重者可有抽搐、昏迷，甚至死亡。輕者不必治療；重者治療主要是立即給予高滲性溶液，如甘露醇、50%葡萄糖或3%氯化鈉10毫升，也可輸白蛋白，必要時鎮靜劑及其他對癥治療；更嚴重者終止透析。
（2）透析使用綜合癥：主要是應用新透析器及管道所引起的。治療：主要是對癥治療。
（3）低血壓：最為常見血液透析的副作用之一，發病率為20%～40%。發生低血壓的原因很多，這種低血壓多數發生在透析開始時后中后期。透析后期的血壓下降多由于超濾過快或對醋酸鹽透析液不適應所致。治療：頭低腳高位，停超濾，減慢泵流速，吸氧，必要時快速補充生理鹽水100～200毫升或50%葡萄糖20毫升，輸注白蛋白，并結合病因，對因治療。
（4）致熱原反應：通常不用藥，高熱時可降低透析溫度，抗胺藥、激素和退熱藥等酌情使用。
（5）心力衰竭：是血液透析中最為危險、嚴重的副作用之一，治療上對癥治療外，應采用順序透析或加強超濾。
（6）心律失常：發生率約50%，以室性早博為多見。引起血液透析的副作用原因有冠心病、功能衰竭、心包炎、嚴重貧血、電解質及酸堿平衡紊亂、低氧血癥、低血壓及藥物等。治療：對因及對癥治療，但需注意藥物在透析病人體內的潴留和毒性作用。
（7）透析中肌肉痙攣：是血液透析較為常見的副作用之一，發生率10%～15%，主要部位為排腸肌、足部，其他部位有上肢及腹部肌肉。產生的原因還不十分清楚，可能與透析中組織缺氧、低鈉和循環血量相對不足行關。治療：減慢或暫停超濾，輸入生理鹽水100～200毫升或高滲糖水及高滲鹽水。
透析療法需要長期進行，不能中斷。否則可能導致原來的療效功虧一簣，甚至威脅生命。對于尿毒癥終末期的患者而言，只能用血液透析器替代。