首先需要鑒別正常的重復行為，以免草木皆兵、診斷擴大化。幾乎每個人都會有些重復行為或有既定順序的動作，比如離開家前會反復拉兩三次門以確保門關上了；刷牙總是會按照先用左手拿杯子裝水，再用右手取牙刷，接著用左手擠牙膏的順序進行。一般這種習慣行為是為了提高效率，并不讓人感到痛苦，也不影響正常生活。而明確有強迫癥狀的患者則需要與以下疾病相鑒別：
1.精神分裂癥
該病患者也可產生強迫癥狀，但往往不以強迫為苦惱，更不會主動尋求治療，強迫思維的內容多怪誕離奇且有幻覺妄想等精神病性癥狀，一般容易鑒別，但嚴重的強迫癥病人有時也可伴有短暫的精神病性癥狀，應注意辨別。
2.抑郁癥
該病患者可出現強迫癥狀，而強迫癥患者也可產生抑郁情緒，鑒別主要是識別哪些是原發性的癥狀、出現在先。
3.焦慮癥
兩者都可有焦慮表現，強迫癥的焦慮多因強迫思維的反復出現或強迫行為無法實施而出現，相比之下，焦慮癥的焦慮可以是無緣無故、缺乏特定對象的。
4.藥物引起的強迫癥狀
一些藥物，如氯氮平在治療精神分裂癥過程中可引起強迫癥狀，但患者并不感到苦惱，停藥后癥狀逐漸緩解消失。
5.器質性精神障礙
大腦某些部位的器質性病變，如出血或梗死可出現強迫癥狀，所以在診斷時詢問相關腦血管疾病病史，完成頭顱磁共振等相關輔助檢查是相當必要的。