球孢子菌病主要發生于半干旱氣候的地區，以美國的西南地區和南美洲及中美洲的某些地區為多見。吸入真菌后，可無癥狀，或引起急性和慢性肺炎。有些患者，感染可擴散至呼吸道以外組織，主要為皮膚、骨、關節和腦膜。這種并發癥多見于男性，尤其是菲律賓人和黑人，以及艾滋病和其他免疫系統受損者。采集痰液標本或其他感染部位標本進行真菌檢查或血液抗體檢查可確定診斷。治療主要包括抗真菌藥物，如氟康唑和兩性霉素B。
芽生菌病主要發生于美國的東南、中南和中西部地區，以及北美洲大湖周圍地區。被吸入后，真菌主要引起肺部感染；但是感染后一般不出現癥狀。有些患者出現流感樣癥狀。少數情況下，慢性肺部感染的癥狀可持續數月。病變可擴散至身體其他部位，以皮膚、骨、關節和前列腺為多見。通常其診斷依靠痰中檢出真菌。治療主要包括抗真菌藥物，如伊曲康唑或兩性霉素B。