人類是腸病毒唯一的傳染來源，主要經由腸胃道（糞-口、水、食物污染）或呼吸道（飛沫、咳嗽或打噴嚏）傳染，也可經由接觸病人皮膚水泡的液體而受到感染。在發病前數天，喉嚨部位與糞便就可發現病毒，此時即有傳染力，通常以發病后一周內傳染力最強；而患者可持續經由腸道釋出病毒，時間長達8到12周之久。潛伏期為2到10天，平均約3到5天。腸病毒適合在濕、熱的環境下生存與傳播。
腸道病毒EV71感染疾病是由腸道病毒EV71引起的傳染病，簡稱為EV71.多發生于嬰幼兒，可引起手、足、口腔等部位的皰疹，個別患者可引起心肌炎、肺水腫、無菌性腦膜腦炎等并發癥。
該病的潛伏期為2～7天，傳染源包括患者和隱性感染者。該病傳播方式多樣，以通過人群密切接觸傳播為主。病毒可通過唾液、皰疹液、糞便等污染的手、毛巾、手絹、牙杯、玩具、食具、奶具以及床上用品、內衣等引起間接接觸傳播；患者咽喉分泌物及唾液中的病毒可通過飛沫傳播；如接觸被病毒污染的水源，亦可經水感染。
人群對腸道病毒EV71普遍易感，感染后可獲得免疫力。由于不同病原型別感染后抗體缺乏交叉保護力，因此，人群可反復感染發病。成人大多已通過隱性感染獲得相應抗體，因此，腸道病毒EV71感染疾病的患者主要為學齡前兒童，尤以3歲以下年齡組發病率最高。
腸道病毒EV71感染疾病是全球性傳染病，世界大部分地區均有此病流行的報道。澳大利亞和美國、瑞典一樣，是最早出現EV 71感染的國家之一。1970年腸道病毒71型(EV 71)在美國被首次確認。1972－1973 年、1986年和1999年澳大利亞均發生過EV 71流行，重癥病人大多伴有中樞神經系統癥狀，一些病人還有嚴重的呼吸系統癥狀。20世紀70年代中期，保加利亞、匈牙利相繼暴發以中樞神經系統為主要臨床特征的EV 71流行，僅保加利亞就超過750例發病，149人致癱，44人死亡。日本是腸道病毒EV71感染疾病發病較多的國家，歷史上有過多次大規模流行。20世紀90年代后期，EV71開始肆虐東亞地區。1997年以來，該病在馬來西亞、新加坡等地大規模爆發流行，并發中樞神經系統癥狀而導致死亡病例增多，引起世界各國關注和警惕。1997年4—8月馬來西亞共有2628例發病，4～6月死亡2 9例，死者平均年齡1.5歲。