病理生理
基本病理變化有兩種：早期為彌漫性浸潤滲出性改變，晚期為肉芽腫形成，在早期病灶組織中有大量的新型隱球菌集聚，因菌體周圍包繞膠樣莢膜，使菌與組織沒有直接接觸，故組織炎癥反應不明顯。肉芽腫的形成常在感染數月后，可見巨細胞、巨噬細胞及成纖維細胞的增生，淋巴細胞和漿細胞浸潤，偶見壞死灶及小空洞形成。腦組織較其他更易形成小空洞，腦膜增厚，有肉芽腫形成，偶見壞死灶及小空洞形成。腦組織較其他組織更易形成小空洞，腦膜增厚，有肉芽腫形成，以基底節及皮層的灰質受累最嚴重，肺部病變可見少量淋巴細胞浸潤，肉芽腫形成，廣泛纖維化。
診斷檢查
診斷要點：主要引起中樞神經系統或肺隱球菌病。少見皮膚粘膜隱球菌病，多數為繼發性損害，皮損可表現為單發或多發的丘疹，結節，中央有臍窩，可似傳染性軟疣，亦可破潰，形成膿瘍，排出少量粘性膿液，內有隱球菌。還可表現為肉芽腫樣等多種類型損害。實驗室檢查，尋找病原。
1、病原體檢查
①墨汁染色法：是迅速、簡便、可靠的方法，根據受損部位不同取所需檢查的新鮮標本，如腦脊液、痰液、病灶組織或滲液等，置于玻片上，加墨汁1滴，覆以蓋玻片，在顯微鏡暗視野下找隱球菌，可見圓形菌體，外軸有一圈透明的肥厚莢膜，內有反光孢子，但無菌絲。反復多次查找陽性率高，腦脊液應離心后取沉淀涂片。
②真菌培養：取標本少許置于沙氏培養基中，在室溫或37℃培養3—4天可見菌落長出。
2、血清學檢查
由于病人血清中可測到的抗體不多，因此檢測抗體陽性率不高，特異性不強，僅作輔導診斷。通常檢測新型隱球菌莢膜多糖體抗原，以乳膠凝集試驗靈感而特異，且有估計預后和療效的作用。
治療原則
1.應首先在感染部位采取標本進行涂片檢查及培養，找到病原真菌時方可確診。自無菌部位采取的標本培養陽性者為疑似病例。
2.根據感染部位、病原菌種類選擇用藥。
3.療程需較長，一般為6～12周或更長。
4.嚴重感染的治療應聯合應用具有協同作用的抗真菌藥物，并應靜脈給藥，以增強療效并延緩耐藥菌株的產生。
5.在應用抗真菌藥物的同時，應積極治療可能存在的基礎疾病，增強機體免疫功能。
6.有指征時需進行外科手術治療。