端粒酶的調控正常動物體細胞中端粒酶處于靜止狀態；
而在干細胞中，端粒酶RNA表達較高，端粒酶處于活化狀態，隨著干細胞的分化，端粒酶活性逐漸降低，至終末分化細胞已檢測不出端粒酶活性。
缺乏端粒酶的小鼠到第六代時出現了脫毛、傷口上皮再生障礙、造血干細胞再生受阻等異常，表明端粒酶水平的高低直接影響上皮干細胞的增殖和分化。
