吸收：口服吸收良好，進食不影響藥物的生物利用度。
代謝：氟西汀具有非線性的藥代動力學特征，首先通過肝臟效應。
通常在服用后6到8小時達到最大血漿濃度。氟西汀通過多態脢CYP2D6廣泛的代謝。主要通過肝臟代謝，去甲基產生活性代謝產物諾氟西汀(去甲氟西汀)。
排泄：氟西汀的消除半衰期4~6天，去甲氟西汀為4~16天。長的半衰期是造成停藥后任在體內存留5到6周的原因。主要通過腎臟排泄，可分泌到乳汁中。
