一些蛋白質能與P53蛋白作用，導致其正常生物學功能的喪失，DNA腫瘤病毒如 HPV16、18、SV40和腺病毒編碼癌蛋白，引起宿主細胞的惡性病變，這些癌蛋白如 SV40T抗原、腺病毒ELa、ELb、HPVE6能與Rb，P53結合。Scheffner證實，HPVE6結合 P53后，啟動細胞內蛋白酶降解P53，從而降低P53正常功能。而SV40T，腺病毒ELb沒有 發現這種降解作用方式。此外，P53還可以被細胞基因產物相互作用而失活，如MDM2可 結合P53而使其失活，在一些常見的人類肉瘤中，都有MDM2基因擴增，這種擴增可能干擾P53的正常功能。
